Laboratorije Fakulteta su raspoređene se po Institutima, svrstane prema naučnim užim oblastima kojima se Fakultet bavi.
U tabeli (dolje), je dat pregled svih laboratorija raspoređenih po institutima.
Pored ovih laboratorija svrstanih po institutima, na Poljoprivrednom fakultetu djeluju i dvije centralne laboratorije:
Ove dvije laboratorije studentima omogućuju da savladaju klasične metoda analize i mjerenja, kao i rad na savremenoj mjernoj i analitičkoj opremi u laboratorijama u toku izvođenja praktičnog djela nastave.
Laboratorijske vježbe i naučno-istraživački rad izvode se u laboratorijama, koje raspolažu kadrovima čija obrazovna struktura, osposobljenost i radno iskustvo obezbjeđuju visok nivo znanja koje se prenosi studentima, maksimalnu funkcionalnost laboratorija, kao i pružanje pouzdanih i pravovremenih usluga.